Le proteine sono costituite da una combinazione di amminoacidi. Rappresentano la materia vivente: pelle, muscoli, organi interni, unghie, capelli, cervello, struttura ossea. La Clorella è uno degli alimenti più ricchi di proteine, poiché ne contiene il 60%. Inoltre, essa contiene 18 tipi di amminoacidi differenti, tra gli 22 presenti nella natura, li quali, combinati fra loro diventano le proteine presenti nel corpo umano.

Le proteine servono alla produzione degli anticorpi, degli ormoni, degli enzimi e dei globuli.