Die Proteine werden durch die Ansammlung von Aminosäuren gebildet. Sie stellen die lebende Materie dar: Haut, Muskeln, interne Organe, Nägel, Haare, Gehirn, Knochengerüst. Die Chlorella ist eines der Nahrungsmittel mit dem höchsten Gehalt an Proteinen, denn sie besteht zu 60% daraus. Ausserdem besitzt sie 18 verschiedene Aminosäuren, von 22, die es in der Natur gibt, die zusammen kombiniert die Proteine des Körpers bilden.
Die Proteine dienen der Herstellung von Antikörpern, Hormonen, Enzymen und Blutkörperchen.